S3 데이터 업로드

데이터 설명

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/?term=SRR6327875

 

NOTE: SRA Lite 포멧에 대한 설명

 

다운로드

wget https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos5/sra-pub-zq-14/SRR006/327/SRR6327875.sralite.1

R1, R2 파일로 추출

fastq-dump --split-files --gzip SRR6327875.sralite.1

AWS CLI 사용을 위한 credential 적용 

아래의 정보를 쉘에 복사하여 붙여넣습니다.

버킷 생성

aws s3api create-bucket \
    --bucket brandon-20230927 \
    --region us-east-1

AWS 계정 내 생성된 버킷 확인

aws s3 ls

fastq-dump --split-files --gzip SRR6327875