Hail on EC2 (옵션)

앞에서 배운 것들을 토대로 새로운 EC2를 생성하고 접속한 뒤 오픈소스 프로그램인 Hail 을 설치 및 사용해 봅시다.

Python3 버전 확인

python3 --version

Python3는 설치되어 있다면 아래와 같이 pip을 설치합니다.

curl -O https://bootstrap.pypa.io/get-pip.py

python3 get-pip.py --user

Hail 툴 의존성 패키지 및 프로그램 설치

sudo yum install -y java-11-amazon-corretto-headless
sudo yum groupinstall -y "Development Tools"
sudo yum install -y lapack-devel blas-devel

Hail 설치

pip install hail

Hail 테스트

import hail as hl
mt = hl.balding_nichols_model(n_populations=3,
                              n_samples=10,
                              n_variants=100)
mt.show()

---

참고문서

• https://hail.is/docs/0.2/install/try.html
• https://docs.aws.amazon.com/ko_kr/corretto/latest/corretto-11-ug/amazon-linux-install.html
• https://docs.aws.amazon.com/ko_kr/AWSEC2/latest/UserGuide/compile-software.html