AWS HealthOmics
- AWS HealthOmics now supports DSL and Nextflow version detection (2024년 8월 14일)
- 워크플로우 언어의 버전을 지정하여 사용할 수 있습니다. (공식 문서)
AWS HealthOmics 소개 및 주요 링크
홈페이지, 공식 유저 가이드 AWS HealthOmics는 생물정보학자, 연구원, 과학자와 같은 사용자가 유전체학 및 기타 생물학적 데이터를 저장, 쿼리, 분석 및 분석하여...
AWS HealthOmics로 유전체 분석 (Fastq to VCF, Annotation) 자동화하기
cd aws-healthomics-eventbridge-integration/workflows/vep aws stepfunctions start-execution \ ...
AWS HealthOmics에서 Annotation 작업 수행하기
AWS HealthOmics의 Analytics 기능을 활용하여 annotation작업을 수행할 수 있습니다. 준비물 입력 샘플 VCF Annotation할 ...
AWS HealthOmics - Storage
오믹스의 스토리지 컴포넌트는 2개가 있습니다. Reference store Sequence stores 이름에서도 알 수 있듯이 레퍼런스 스토어는 1개만 생성이 ...
AWS HealthOmics로 Nf-core 워크플로우 마이그레이션 하기 (scrnaseq)
참고문서: https://catalog.us-east-1.prod.workshops.aws/workshops/76d4a4ff-fe6f-436a-a1c2-f7ce44bc5d...
AWS HealthOmics로 Nf-core 워크플로우 마이그레이션 하기 (rnaseq)
참고 문서: https://catalog.us-east-1.prod.workshops.aws/workshops/76d4a4ff-fe6f-436a-a1c2-f7ce44bc5d1...
AWS HealthOmics - Troubleshooting
공식문서 https://docs.aws.amazon.com/omics/latest/dev/troubleshooting.html ECR_PERMISSION_...
몇 가지 기능과 알아둘 것들
서비스 Quota와 리전 AWS의 거의 모든 서비스가 그러하듯 HealthOmics에서도 Quota가 존재합니다. 또한 사용 가능한 리전이 현재 제한적입니다. (서울 리...
AWS HealthOmics로 WDL 워크플로우 마이그레이션 하기 (HiFi-human-WGS-WDL)
다음 문서는 WDL 워크플로우를 HealthOmics의 Private workflow에 등록하는 내용을 다루고 있습니다. 대상 워크플로우 주소: https://git...