Store multimodal data with purpose-built Health AI services

 

이번 세션에서는 특수 목적의 헬스 AI 서비스(AWS HealthOmics, AWS HealthLake, AWS HealthImaging)로 멀티모달 데이터를 저장할 수 있습니다.

각 데이터 유형 별로 알맞는 서비스에 저장하려면 해당 폴더에 있는 아티팩트를 따르세요. 

• genomic - Run the notebook store-multimodal-data/genomic/store-analyze-genomicdata-with-awshealthomics.ipynb. This creates AWS HealthOmics data stores (Reference Store, Variant Store, and Annotation Store) to import reference genome, VCF files, and ClinVar annotation file.
• clinical - Follow the instructions in store-multimodal-data/clinical/README.md to create AWS HealthLake data store and import NDJSON files.
• medical imaging - First, run the notebook store-multimodal-data/medical_imaging/store-imagingdata-with-awshealthimaging.ipynb to create AWS HealthImaging data stores and import DICOM files. Then, run preprocess-multimodal-date/medical-imaging/imaging-radiomics.ipynb to generate radiomic features from multimple images in parallel using Amazon SageMaker Preprocessing.

 

 

Genomic

• VCF를 Import하는데 수분이 걸릴 수 있습니다.

데이터 Import 전에 Database 만들기

Athena

# 데이터에 대해 아테나 쿼리를 실행하려면, AWS Lake Formation을 사용해 데이터베이스에 대한 리소스 링크를 생성하세요.
# 다음 기능이 작동하려면 이 노트북을 실행하는 IAM 사용자가 데이터 레이크 관리자인지 확인해야 합니다.